The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits.
Ji
Chen
;
Cassandra N
Spracklen
;
Gaëlle
Marenne
;
Arushi
Varshney
;
Laura J
Corbin
;
Jian'an
Luan
;
Sara M
Willems
;
Ying
Wu
;
Xiaoshuai
Zhang
;
Momoko
Horikoshi
;
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Thibaud S
Boutin
;
Reedik
Mägi
;
Johannes
Waage
;
Ruifang
Li-Gao
;
Kei Hang Katie
Chan
;
Jie
Yao
;
Mila D
Anasanti
;
Audrey Y
Chu
;
Annique
Claringbould
;
Jani
Heikkinen
;
Jaeyoung
Hong
;
Jouke-Jan
Hottenga
;
Shaofeng
Huo
;
Marika A
Kaakinen
;
Tin
Louie
;
Winfried
März
;
Hortensia
Moreno-Macias
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Anne
Ndungu
;
Sarah C
Nelson
;
Ilja M
Nolte
;
Kari E
North
;
Chelsea K
Raulerson
;
Debashree
Ray
;
Rebecca
Rohde
;
Denis
Rybin
;
Claudia
Schurmann
;
Xueling
Sim
;
Lorraine
Southam
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Isobel D
Stewart
;
Carol A
Wang
;
Yujie
Wang
;
Peitao
Wu
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Weihua
Zhang
;
Tarunveer S
Ahluwalia
;
Emil VR
Appel
;
Lawrence F
Bielak
;
Jennifer A
Brody
;
Noël P
Burtt
;
Claudia P
Cabrera
;
Brian E
Cade
;
Jin Fang
Chai
;
Xiaoran
Chai
;
Li-Ching
Chang
;
Chien-Hsiun
Chen
;
Brian H
Chen
;
Kumaraswamy Naidu
Chitrala
;
Yen-Feng
Chiu
;
Hugoline G
de Haan
;
Graciela E
Delgado
;
Ayse
Demirkan
;
Qing
Duan
;
Jorgen
Engmann
;
Segun A
Fatumo
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Javier
Gayán
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Franco
Giulianini
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Jung Ho
Gong
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Stefan
Gustafsson
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Yang
Hai
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Fernando P
Hartwig
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Jing
He
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Yoriko
Heianza
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Tao
Huang
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Alicia
Huerta-Chagoya
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Mi Yeong
Hwang
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Richard A
Jensen
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Takahisa
Kawaguchi
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Katherine A
Kentistou
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Young Jin
Kim
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Marcus E
Kleber
;
Ishminder K
Kooner
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Shuiqing
Lai
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Leslie A
Lange
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Carl D
Langefeld
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Marie
Lauzon
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Man
Li
;
Symen
Ligthart
;
Jun
Liu
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Marie
Loh
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Jirong
Long
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Valeriya
Lyssenko
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Massimo
Mangino
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Carola
Marzi
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May E
Montasser
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Abhishek
Nag
;
Masahiro
Nakatochi
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Damia
Noce
;
Raymond
Noordam
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Giorgio
Pistis
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Michael
Preuss
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Laura
Raffield
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Laura J
Rasmussen-Torvik
;
Stephen S
Rich
;
Neil R
Robertson
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Rico
Rueedi
;
Kathleen
Ryan
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Serena
Sanna
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Richa
Saxena
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Katharina E
Schraut
;
Bengt
Sennblad
;
Kazuya
Setoh
;
Albert V
Smith
;
Thomas
Sparsø
;
Rona J
Strawbridge
;
Fumihiko
Takeuchi
;
Jingyi
Tan
;
Stella
Trompet
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Erik
van den Akker
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Peter J
van der Most
;
Niek
Verweij
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Mandy
Vogel
;
Heming
Wang
;
Chaolong
Wang
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Nan
Wang
;
Helen R
Warren
;
Wanqing
Wen
;
Tom
Wilsgaard
;
Andrew
Wong
;
Andrew R
Wood
;
Tian
Xie
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Mohammad Hadi
Zafarmand
;
Jing-Hua
Zhao
;
Wei
Zhao
;
Najaf
Amin
;
Zorayr
Arzumanyan
;
Arne
Astrup
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Stephan JL
Bakker
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Damiano
Baldassarre
;
Marian
Beekman
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Richard N
Bergman
;
Alain
Bertoni
;
Matthias
Blüher
;
Lori L
Bonnycastle
;
Stefan R
Bornstein
;
Donald W
Bowden
;
Qiuyin
Cai
;
Archie
Campbell
;
Harry
Campbell
;
Yi Cheng
Chang
;
Eco JC
de Geus
;
Abbas
Dehghan
;
Shufa
Du
;
Gudny
Eiriksdottir
;
Aliki Eleni
Farmaki
;
Mattias
Frånberg
;
Christian
Fuchsberger
;
Yutang
Gao
;
Anette P
Gjesing
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Anuj
Goel
;
Sohee
Han
;
Catharina A
Hartman
;
Christian
Herder
;
Andrew A
Hicks
;
Chang-Hsun
Hsieh
;
Willa A
Hsueh
;
Sahoko
Ichihara
;
Michiya
Igase
;
M Arfan
Ikram
;
W Craig
Johnson
;
Marit E
Jørgensen
;
Peter K
Joshi
;
Rita R
Kalyani
;
Fouad R
Kandeel
;
Tomohiro
Katsuya
;
Chiea Chuen
Khor
;
Wieland
Kiess
;
Ivana
Kolcic
;
Teemu
Kuulasmaa
;
Johanna
Kuusisto
;
Kristi
Läll
;
Kelvin
Lam
;
Deborah A
Lawlor
;
Nanette R
Lee
;
Rozenn N
Lemaitre
;
Honglan
Li
;
Lifelines Cohort Study
;
Shih-Yi
Lin
;
Jaana
Lindström
;
Allan
Linneberg
;
Jianjun
Liu
;
Carlos
Lorenzo
;
Tatsuaki
Matsubara
;
Fumihiko
Matsuda
;
Geltrude
Mingrone
;
Simon
Mooijaart
;
Sanghoon
Moon
;
Toru
Nabika
;
Girish N
Nadkarni
;
Jerry L
Nadler
;
Mari
Nelis
;
Matt J
Neville
;
Jill M
Norris
;
Yasumasa
Ohyagi
;
Annette
Peters
;
Patricia A
Peyser
;
Ozren
Polasek
;
Qibin
Qi
;
Dennis
Raven
;
Dermot F
Reilly
;
Alex
Reiner
;
Fernando
Rivideneira
;
Kathryn
Roll
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Igor
Rudan
;
Charumathi
Sabanayagam
;
Kevin
Sandow
;
Naveed
Sattar
;
Annette
Schürmann
;
Jinxiu
Shi
;
Heather M
Stringham
;
Kent D
Taylor
;
Tanya M
Teslovich
;
Betina
Thuesen
;
Paul RHJ
Timmers
;
Elena
Tremoli
;
Michael Y
Tsai
;
Andre
Uitterlinden
;
Rob M
van Dam
;
Diana
van Heemst
;
Astrid
van Hylckama Vlieg
;
Jana V
van Vliet-Ostaptchouk
;
Jagadish
Vangipurapu
;
Henrik
Vestergaard
;
Tao
Wang
;
Ko
Willems van Dijk
;
Tatijana
Zemunik
;
Gonçalo R
Abecasis
;
Linda S
Adair
;
Carlos Alberto
Aguilar-Salinas
;
Marta E
Alarcón-Riquelme
;
Ping
An
;
Larissa
Aviles-Santa
;
Diane M
Becker
;
Lawrence J
Beilin
;
Sven
Bergmann
;
Hans
Bisgaard
;
Corri
Black
;
Michael
Boehnke
;
Eric
Boerwinkle
;
Bernhard O
Böhm
;
Klaus
Bønnelykke
;
DI
Boomsma
;
Erwin P
Bottinger
;
Thomas A
Buchanan
;
Mickaël
Canouil
;
Mark J
Caulfield
;
John C
Chambers
;
Daniel I
Chasman
;
Yii-Der Ida
Chen
;
Ching-Yu
Cheng
;
Francis S
Collins
;
Adolfo
Correa
;
Francesco
Cucca
;
H Janaka
de Silva
;
George
Dedoussis
;
Sölve
Elmståhl
;
Michele K
Evans
;
Ele
Ferrannini
;
Luigi
Ferrucci
;
Jose C
Florez
;
Paul W
Franks
;
Timothy M
Frayling
;
Philippe
Froguel
;
Bruna
Gigante
;
Mark O
Goodarzi
;
Penny
Gordon-Larsen
;
Harald
Grallert
;
Niels
Grarup
;
Sameline
Grimsgaard
;
Leif
Groop
;
Vilmundur
Gudnason
;
Xiuqing
Guo
;
Anders
Hamsten
;
Torben
Hansen
;
Caroline
Hayward
;
Susan R
Heckbert
;
Bernardo L
Horta
;
Wei
Huang
;
Erik
Ingelsson
;
Pankow S
James
;
Marjo-Ritta
Jarvelin
;
Jost B
Jonas
;
J Wouter
Jukema
;
Pontiano
Kaleebu
;
Robert
Kaplan
;
Sharon LR
Kardia
;
Norihiro
Kato
;
Sirkka M
Keinanen-Kiukaanniemi
;
Bong-Jo
Kim
;
Mika
Kivimaki
;
Heikki A
Koistinen
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Jaspal S
Kooner
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Antje
Körner
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Peter
Kovacs
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Diana
Kuh
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Meena
Kumari
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Zoltan
Kutalik
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Markku
Laakso
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Timo A
Lakka
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Lenore J
Launer
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Leander
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Huaixing
Li
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Xu
Lin
;
Lars
Lind
;
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Lindgren
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Simin
Liu
;
Ruth JF
Loos
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Magnusson
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Anubha
Mahajan
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Andres
Metspalu
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Dennis O
Mook-Kanamori
;
Trevor A
Mori
;
Patricia B
Munroe
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Inger
Njølstad
;
Jeffrey R
O'Connell
;
Albertine J
Oldehinkel
;
Ken K
Ong
;
Sandosh
Padmanabhan
;
Colin NA
Palmer
;
Nicholette D
Palmer
;
Oluf
Pedersen
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Craig E
Pennell
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Porteous
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Michael A
Province
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Bruce M
Psaty
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Lu
Qi
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Rainer
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Frits R
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Saaristo
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Sandhu
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Jouko
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Neil
Schneiderman
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Peter
Schwarz
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Laura J
Scott
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Elizabeth
Selvin
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Peter
Sever
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Xiao-Ou
Shu
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P Eline
Slagboom
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Kerrin S
Small
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Blair H
Smith
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Harold
Snieder
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Sofer
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Sørensen
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Tim D
Spector
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Alice
Stanton
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Claire J
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Michael
Stumvoll
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Liang
Sun
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Yasuharu
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E Shyong
Tai
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Nicholas J
Timpson
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Anke
Tönjes
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Veronique
Vitart
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Peter
Vollenweider
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Tanja GM
Vrijkotte
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Lynne E
Wagenknecht
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Mark
Walker
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Ya X
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Nick J
Wareham
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Richard M
Watanabe
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Hugh
Watkins
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Wen B
Wei
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Ananda R
Wickremasinghe
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Willemsen
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Yengo
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Zeggini
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Zheng
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Alan B
Zonderman
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Jerome I
Rotter
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Anna L
Gloyn
;
Mark I
McCarthy
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Josée
Dupuis
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James B
Meigs
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Robert A
Scott
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Inga
Prokopenko
;
Aaron
Leong
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Ching-Ti
Liu
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Parker
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Karen L
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Claudia
Langenberg
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Eleanor
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Andrew P
Morris
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Inês
Barroso
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Meta-Analysis of Glucose and Insulin-related Traits Consortium (
;
(2021)
The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits.
Nature genetics, 53 (6).
pp. 840-860.
ISSN 1061-4036
DOI: 10.1038/s41588-021-00852-9
;
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Reedik
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Johannes
Waage
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Chan
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Mila D
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Huo
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März
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Ndungu
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Nelson
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Ilja M
Nolte
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Chelsea K
Raulerson
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Debashree
Ray
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Rebecca
Rohde
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Xueling
Sim
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Stewart
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Wang
;
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Wang
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Wu
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Weihua
Zhang
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Ahluwalia
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Emil VR
Appel
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Lawrence F
Bielak
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Jennifer A
Brody
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Noël P
Burtt
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Claudia P
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Brian E
Cade
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Jin Fang
Chai
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Xiaoran
Chai
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Chang
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Chien-Hsiun
Chen
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Brian H
Chen
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Kumaraswamy Naidu
Chitrala
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Yen-Feng
Chiu
;
Hugoline G
de Haan
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Graciela E
Delgado
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Ayse
Demirkan
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Qing
Duan
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Jorgen
Engmann
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Segun A
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Tao
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Marcus E
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Lange
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Carl D
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Man
Li
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Wang
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Wanqing
Wen
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Tom
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Andrew
Wong
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Andrew R
Wood
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Tian
Xie
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Mohammad Hadi
Zafarmand
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Jing-Hua
Zhao
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Wei
Zhao
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Campbell
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Campbell
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Chang
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Du
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Han
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M Arfan
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Khor
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Allan
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Moon
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Chen
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Cheng
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Francis S
Collins
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Correa
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Francesco
Cucca
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George
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Ele
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Goodarzi
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Gordon-Larsen
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Grallert
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Niels
Grarup
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Sameline
Grimsgaard
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Leif
Groop
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Vilmundur
Gudnason
;
Xiuqing
Guo
;
Anders
Hamsten
;
Torben
Hansen
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Caroline
Hayward
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Susan R
Heckbert
;
Bernardo L
Horta
;
Wei
Huang
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Erik
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Pankow S
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Marjo-Ritta
Jarvelin
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Jost B
Jonas
;
J Wouter
Jukema
;
Pontiano
Kaleebu
;
Robert
Kaplan
;
Sharon LR
Kardia
;
Norihiro
Kato
;
Sirkka M
Keinanen-Kiukaanniemi
;
Bong-Jo
Kim
;
Mika
Kivimaki
;
Heikki A
Koistinen
;
Jaspal S
Kooner
;
Antje
Körner
;
Peter
Kovacs
;
Diana
Kuh
;
Meena
Kumari
;
Zoltan
Kutalik
;
Markku
Laakso
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Timo A
Lakka
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Launer
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Karin
Leander
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Huaixing
Li
;
Xu
Lin
;
Lars
Lind
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Cecilia
Lindgren
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Liu
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Ruth JF
Loos
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Ong
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Colin NA
Palmer
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Nicholette D
Palmer
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Oluf
Pedersen
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Craig E
Pennell
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Porteous
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;
Bruce M
Psaty
;
Lu
Qi
;
Leslie J
Raffel
;
Rainer
Rauramaa
;
Susan
Redline
;
Paul M
Ridker
;
Frits R
Rosendaal
;
Timo E
Saaristo
;
Manjinder
Sandhu
;
Jouko
Saramies
;
Neil
Schneiderman
;
Peter
Schwarz
;
Laura J
Scott
;
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;
Peter
Sever
;
Xiao-Ou
Shu
;
P Eline
Slagboom
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Kerrin S
Small
;
Blair H
Smith
;
Harold
Snieder
;
Tamar
Sofer
;
Thorkild IA
Sørensen
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Tim D
Spector
;
Alice
Stanton
;
Claire J
Steves
;
Michael
Stumvoll
;
Liang
Sun
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Tai
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Nicholas J
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Tönjes
;
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Tuomilehto
;
Teresa
Tusie
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Matti
Uusitupa
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Pim
van der Harst
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Cornelia
van Duijn
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Veronique
Vitart
;
Peter
Vollenweider
;
Tanja GM
Vrijkotte
;
Lynne E
Wagenknecht
;
Mark
Walker
;
Ya X
Wang
;
Nick J
Wareham
;
Richard M
Watanabe
;
Hugh
Watkins
;
Wen B
Wei
;
Ananda R
Wickremasinghe
;
Gonneke
Willemsen
;
James F
Wilson
;
Tien-Yin
Wong
;
Jer-Yuarn
Wu
;
Anny H
Xiang
;
Lisa R
Yanek
;
Loïc
Yengo
;
Mitsuhiro
Yokota
;
Eleftheria
Zeggini
;
Wei
Zheng
;
Alan B
Zonderman
;
Jerome I
Rotter
;
Anna L
Gloyn
;
Mark I
McCarthy
;
Josée
Dupuis
;
James B
Meigs
;
Robert A
Scott
;
Inga
Prokopenko
;
Aaron
Leong
;
Ching-Ti
Liu
;
Stephen CJ
Parker
;
Karen L
Mohlke
;
Claudia
Langenberg
;
Eleanor
Wheeler
;
Andrew P
Morris
;
Inês
Barroso
;
Meta-Analysis of Glucose and Insulin-related Traits Consortium (
;
(2021)
The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits.
Nature genetics, 53 (6).
pp. 840-860.
ISSN 1061-4036
DOI: 10.1038/s41588-021-00852-9
Glycemic traits are used to diagnose and monitor type 2 diabetes and cardiometabolic health. To date, most genetic studies of glycemic traits have focused on individuals of European ancestry. Here we aggregated genome-wide association studies comprising up to 281,416 individuals without diabetes (30% non-European ancestry) for whom fasting glucose, 2-h glucose after an oral glucose challenge, glycated hemoglobin and fasting insulin data were available. Trans-ancestry and single-ancestry meta-analyses identified 242 loci (99 novel; P < 5 × 10-8), 80% of which had no significant evidence of between-ancestry heterogeneity. Analyses restricted to individuals of European ancestry with equivalent sample size would have led to 24 fewer new loci. Compared with single-ancestry analyses, equivalent-sized trans-ancestry fine-mapping reduced the number of estimated variants in 99% credible sets by a median of 37.5%. Genomic-feature, gene-expression and gene-set analyses revealed distinct biological signatures for each trait, highlighting different underlying biological pathways. Our results increase our understanding of diabetes pathophysiology by using trans-ancestry studies for improved power and resolution.
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